В Шебекинском районе выращивают 62 вида культурных растений, а также растут 121 родственных им диких вида.
На территории региона растут 134 видов сорняков и зафиксировано 132 различных болезней растений.
Почвенная карта Шебекинского района представлена 4 видами грунта.