В Монгуне-Тайгинском кожуун выращивают 21 вида культурных растений, а также растут 102 родственных им диких вида.
На территории региона растут 53 видов сорняков и зафиксировано 11 различных болезней растений.
Почвенная карта Монгуна-Тайгинского кожуун представлена 5 видами грунта.