В Бае-Тайгинском кожуун выращивают 25 вида культурных растений, а также растут 114 родственных им диких вида.
На территории региона растут 74 видов сорняков и зафиксировано 35 различных болезней растений.
Почвенная карта Бая-Тайгинского кожуун представлена 7 видами грунта.