В Шушенском районе выращивают 53 вида культурных растений, а также растут 123 родственных им диких вида.
На территории региона растут 84 видов сорняков и зафиксировано 92 различных болезней растений.
Почвенная карта Шушенского района представлена 8 видами грунта.