В Мотыгинском районе выращивают 28 вида культурных растений, а также растут 68 родственных им диких вида.
На территории региона растут 50 видов сорняков и зафиксировано 6 различных болезней растений.
Почвенная карта Мотыгинского района представлена 8 видами грунта.