В Боготольском районе выращивают 49 вида культурных растений, а также растут 93 родственных им диких вида.
На территории региона растут 80 видов сорняков и зафиксировано 87 различных болезней растений.
Почвенная карта Боготольского района представлена 3 видами грунта.