В Карачаевске выращивают 40 вида культурных растений, а также растут 158 родственных им диких вида.
На территории региона растут 110 видов сорняков и зафиксировано 26 различных болезней растений.
Почвенная карта Карачаевска представлена 1 видами грунта.