В Малокарачаевском районе выращивают 66 вида культурных растений, а также растут 174 родственных им диких вида.
На территории региона растут 123 видов сорняков и зафиксировано 128 различных болезней растений.
Почвенная карта Малокарачаевского района представлена 4 видами грунта.