В Мышкинском районе выращивают 52 вида культурных растений, а также растут 86 родственных им диких вида.
На территории региона растут 113 видов сорняков и зафиксировано 103 различных болезней растений.
Почвенная карта Мышкинского района представлена 2 видами грунта.