В Вытегорском районе выращивают 44 вида культурных растений, а также растут 76 родственных им диких вида.
На территории региона растут 84 видов сорняков и зафиксировано 52 различных болезней растений.
Почвенная карта Вытегорского района представлена 5 видами грунта.