В Вагайскии район выращивают 48 вида культурных растений, а также растут 76 родственных им диких вида.
На территории региона растут 91 видов сорняков и зафиксировано 87 различных болезней растений.
Почвенная карта Вагайския район представлена 7 видами грунта.