В Южно-Сахалинске выращивают 25 вида культурных растений, а также растут 46 родственных им диких вида.
На территории региона растут 18 видов сорняков и зафиксировано 37 различных болезней растений.
Почвенная карта Южно-Сахалинска представлена 4 видами грунта.