В Усть-Ишиме произрастают 177 видов растений. Из них 15.82% культивируются людьми, 41.81% являются дикими растениями, а 42.37% - сорняки.
Вредители Усть-Ишима представленны 87 типами.
Растительность подвержена 22 заболеваниям.
Почвенная карта Усть-Ишима представлена 9 видами грунта.