В Холмогорском районе выращивают 20 вида культурных растений, а также растут 64 родственных им диких вида.
На территории региона растут 66 видов сорняков и зафиксировано 22 различных болезней растений.
Почвенная карта Холмогорского района представлена 6 видами грунта.